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檢察院在審查起訴階段發現有新的犯罪事實，在事實清楚、證據充分的情況下，可以直接起訴，或者退回公安機關補充偵查，屬于檢察院管轄范圍內的自行偵查。 相關規定：《刑事訴訟法》第一百七十一條人民檢察院審查案件，可以要求公安機關提供法庭審判所必需的證據材料;認為可能存在本法第五十四條規定的以非法方法收集證據情形的，可以要求其對證據收集的合法性作出說明。

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